そこで、プロセスを監視し、監視対象に対し何らかの操作を行うアプリがあったのでメモ。
Bill2's Process Managerこれ系をかなり探しましたが、できる内容はさることながら、最新状態ではないWindows2000Serverでも動作する点が気に入っています。
インストール時にポータブルモード を選択すると、設定ファイルをXMLで管理するようです。
同じ設定を複数台で稼働させるなら、ポータブルモードにするといいかもしれません。
起動後にウィンドウを最小化させたい場合は、下記のパラメータをつけて起動させましょう。
ProcessManager.exe -minimized